arvkevi/ezancestry

这是什么？

核心功能

• 01支持从 23andMe、ancestry.com 和 VCF 文件预测祖源
• 02将用户样本与 2500 多个 1000 Genomes 样本进行比较
• 03内置 Kidd（55 个位点）和 Seldin（128 个位点）两套预训练 k 近邻模型
• 04支持超级人群和具体人群两个层级的预测
• 05允许用户基于自定义 AISNP 位点训练模型并生成交叉验证报告
• 06提供三维散点图命令和 Streamlit 可视化应用

适用场景

• 将消费级基因检测结果与参考人群并排可视化
• 评估自定义祖源信息 SNP 位点集区分人群的能力
• 使用 1000 Genomes 数据讲授或演示祖源推断
• 对一批基因型文件进行批量祖源预测

快速上手

1. 1

   使用 pip 安装 ezancestry

   pip install ezancestry
2. 2

   从你的直接消费者基因数据文件预测祖源

   ezancestry predict mygenome.txt
3. 3

   在浏览器中以三维散点图可视化预测结果

   ezancestry plot predictions.csv

使用前须知

• !预测仅基于一小部分祖源信息SNP，并与1000 Genomes样本比较，因此结果只是近似值。
• !不适用于医疗或临床决策，仅是研究和探索工具。

收录于专题

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常见问题

ezancestry 是什么？

基于 1000 Genomes 样本的 Python 工具，可根据消费级基因检测数据预测个人的遗传祖源。 ezancestry 可以从 23andMe、ancestry.com 等消费级基因检测输出的原始文件以及 VCF 文件中预测遗传祖源。它会把用户的基因型与 1000 Genomes 项目中 2500 多个样本放在一起比较，并使用基于祖源信息 SNP（AISNP）训练的 k 近邻分类器，给出洲际和地区人群标签。

ezancestry 可以免费使用吗？用的什么许可证？

ezancestry 以 MIT 许可证开源。用于商业产品前，请先确认许可证条款。

ezancestry 还在维护吗？

半年内有更新。ezancestry 最近一次提交是在 2026年10月7日。

ezancestry 适合用来做什么？

将消费级基因检测结果与参考人群并排可视化 评估自定义祖源信息 SNP 位点集区分人群的能力 使用 1000 Genomes 数据讲授或演示祖源推断 对一批基因型文件进行批量祖源预测

ezancestry 怎么安装和运行？

使用 pip 安装 ezancestry: pip install ezancestry 从你的直接消费者基因数据文件预测祖源: ezancestry predict mygenome.txt 在浏览器中以三维散点图可视化预测结果: ezancestry plot predictions.csv

在哪里获取 ezancestry？

源代码和安装说明在 GitHub 上：https://github.com/arvkevi/ezancestry