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K-Dense-AI/scientific-agent-skills
科学系ライブラリ、データベース、研究ワークフローの使い方をAIコーディングエージェントに教える、検証済みスキル177件のコレクション。
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- 52,771
- フォーク
- 4,678
- 未解決の Issue
- 49
- 最終コミット
- 昨日
これは何?
Scientific Agent Skillsは、特定の科学系パッケージ、データソース、ワークフローが必要なタスクで、Claude Code、Cursor、CodexなどのAIエージェントが読み込める手順書のライブラリです。各スキルはSKILL.md形式のドキュメントで、多くの場合、コード例、参考情報、補助スクリプト、テンプレートを含みます。バイオインフォマティクスやケモインフォマティクスから、臨床研究、材料科学、地理空間分析、科学的な執筆まで、幅広い分野を扱います。
このコレクションでは、PubChem、ChEMBL、UniProt、ClinicalTrials.govなど、公開またはライセンス提供されている約80のデータベースを扱うほか、RDKit、Scanpy、scikit-learn、pymatgen、GeoPandasなど、70を超えるPythonパッケージのスキルを提供しています。オープンなAgent Skills標準に準拠しており、Agent Pluginsパッケージとしてもインストールできます。スキルはバージョンごとに対象を明示し、依存関係も記載しています。また、専用スキルがなくても、エージェントは任意のPythonパッケージを利用できるとプロジェクトは説明しています。
スキルはコードを実行し、エージェントの動作を変えることがあるため、プロジェクトでは各SKILL.mdを確認し、必要なものだけをインストールするよう推奨しています。
主な機能
- 01生物学、化学、医学、物理学、工学、地球科学、データ分析をカバー
- 02ページネーションやデータの出所に関するガイダンスとともに、公開またはライセンス提供されている科学系データベース約80件を解説
- 03RDKit、Scanpy、PyTorch Lightning、pymatgenなどのパッケージについて、バージョンごとのワークフローを提供
- 04オープンなAgent Skills標準に準拠し、Cursor、Claude Code、Codex、Google Antigravityで利用可能
- 05スキルのセキュリティスキャンプロセスとセキュリティレポートを提供
ユースケース
- Scanpyと公開アトラスデータを用いたシングルセルRNA-seq解析
- RDKitとChEMBLを用いたバーチャルスクリーニングや分子特性予測
- 文献レビューと、根拠を追跡できる科学的な執筆
- 研究パイプラインでのプライマー設計や質量分析データの処理
使う前に知っておきたいこと
- 臨床、医療、規制に関するスキルの一部は研究目的のみであり、患者個人の診断、治療、認定に関する判断には使用できません。
- docx、pdf、pptx、xlsx のドキュメントスキルはバンドルされなくなりました。Anthropic のリポジトリから別途インストールする必要があります。
トピック
よくある質問
- scientific-agent-skills とは?
- 科学系ライブラリ、データベース、研究ワークフローの使い方をAIコーディングエージェントに教える、検証済みスキル177件のコレクション。 Scientific Agent Skillsは、特定の科学系パッケージ、データソース、ワークフローが必要なタスクで、Claude Code、Cursor、CodexなどのAIエージェントが読み込める手順書のライブラリです。各スキルはSKILL.md形式のドキュメントで、多くの場合、コード例、参考情報、補助スクリプト、テンプレートを含みます。バイオインフォマティクスやケモインフォマティクスから、臨床研究、材料科学、地理空間分析、科学的な執筆まで、幅広い分野を扱います。
- scientific-agent-skills は無料で使えますか?ライセンスは?
- scientific-agent-skills は MIT ライセンスのオープンソースです。商用製品で使う前にライセンス条件を確認してください。
- scientific-agent-skills は今もメンテナンスされていますか?
- 活発にメンテナンス中。scientific-agent-skills の最終コミットは 2026年10月19日 です。
- scientific-agent-skills は何に使えますか?
- Scanpyと公開アトラスデータを用いたシングルセルRNA-seq解析 RDKitとChEMBLを用いたバーチャルスクリーニングや分子特性予測 文献レビューと、根拠を追跡できる科学的な執筆 研究パイプラインでのプライマー設計や質量分析データの処理
- scientific-agent-skills はどこで入手できますか?
- ソースコードとインストール手順は GitHub にあります:https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills
概要はプロジェクトの README をもとに AI が生成しています。GitHub の数値は毎日更新されます。
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