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K-Dense-AI

K-Dense-AI/scientific-agent-skills

科学系ライブラリ、データベース、研究ワークフローの使い方をAIコーディングエージェントに教える、検証済みスキル177件のコレクション。

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49
最終コミット
昨日

これは何?

Scientific Agent Skillsは、特定の科学系パッケージ、データソース、ワークフローが必要なタスクで、Claude Code、Cursor、CodexなどのAIエージェントが読み込める手順書のライブラリです。各スキルはSKILL.md形式のドキュメントで、多くの場合、コード例、参考情報、補助スクリプト、テンプレートを含みます。バイオインフォマティクスやケモインフォマティクスから、臨床研究、材料科学、地理空間分析、科学的な執筆まで、幅広い分野を扱います。

このコレクションでは、PubChem、ChEMBL、UniProt、ClinicalTrials.govなど、公開またはライセンス提供されている約80のデータベースを扱うほか、RDKit、Scanpy、scikit-learn、pymatgen、GeoPandasなど、70を超えるPythonパッケージのスキルを提供しています。オープンなAgent Skills標準に準拠しており、Agent Pluginsパッケージとしてもインストールできます。スキルはバージョンごとに対象を明示し、依存関係も記載しています。また、専用スキルがなくても、エージェントは任意のPythonパッケージを利用できるとプロジェクトは説明しています。

スキルはコードを実行し、エージェントの動作を変えることがあるため、プロジェクトでは各SKILL.mdを確認し、必要なものだけをインストールするよう推奨しています。

主な機能

  • 01生物学、化学、医学、物理学、工学、地球科学、データ分析をカバー
  • 02ページネーションやデータの出所に関するガイダンスとともに、公開またはライセンス提供されている科学系データベース約80件を解説
  • 03RDKit、Scanpy、PyTorch Lightning、pymatgenなどのパッケージについて、バージョンごとのワークフローを提供
  • 04オープンなAgent Skills標準に準拠し、Cursor、Claude Code、Codex、Google Antigravityで利用可能
  • 05スキルのセキュリティスキャンプロセスとセキュリティレポートを提供

ユースケース

  • Scanpyと公開アトラスデータを用いたシングルセルRNA-seq解析
  • RDKitとChEMBLを用いたバーチャルスクリーニングや分子特性予測
  • 文献レビューと、根拠を追跡できる科学的な執筆
  • 研究パイプラインでのプライマー設計や質量分析データの処理

使う前に知っておきたいこと

  • 臨床、医療、規制に関するスキルの一部は研究目的のみであり、患者個人の診断、治療、認定に関する判断には使用できません。
  • docx、pdf、pptx、xlsx のドキュメントスキルはバンドルされなくなりました。Anthropic のリポジトリから別途インストールする必要があります。

トピック

よくある質問

scientific-agent-skills とは?
科学系ライブラリ、データベース、研究ワークフローの使い方をAIコーディングエージェントに教える、検証済みスキル177件のコレクション。 Scientific Agent Skillsは、特定の科学系パッケージ、データソース、ワークフローが必要なタスクで、Claude Code、Cursor、CodexなどのAIエージェントが読み込める手順書のライブラリです。各スキルはSKILL.md形式のドキュメントで、多くの場合、コード例、参考情報、補助スクリプト、テンプレートを含みます。バイオインフォマティクスやケモインフォマティクスから、臨床研究、材料科学、地理空間分析、科学的な執筆まで、幅広い分野を扱います。
scientific-agent-skills は無料で使えますか?ライセンスは?
scientific-agent-skills は MIT ライセンスのオープンソースです。商用製品で使う前にライセンス条件を確認してください。
scientific-agent-skills は今もメンテナンスされていますか?
活発にメンテナンス中。scientific-agent-skills の最終コミットは 2026年10月19日 です。
scientific-agent-skills は何に使えますか?
Scanpyと公開アトラスデータを用いたシングルセルRNA-seq解析 RDKitとChEMBLを用いたバーチャルスクリーニングや分子特性予測 文献レビューと、根拠を追跡できる科学的な執筆 研究パイプラインでのプライマー設計や質量分析データの処理
scientific-agent-skills はどこで入手できますか?
ソースコードとインストール手順は GitHub にあります:https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills

概要はプロジェクトの README をもとに AI が生成しています。GitHub の数値は毎日更新されます。

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